La recherche fondamentale est très onéreuse et très incertaine pour le secteur privé.
Pourquoi, selon la théorie économique, le marché libre échoue-t-il à financer un niveau "optimal" de Recherche et Développement (R&D) et pourquoi l'État doit-il massivement subventionner ou protéger l'innovation ? Plusieurs réponses possibles
Le libre marché sous-investit dans la R&D car l'innovation et la connaissance génèrent de fortes externalités positives (la diffusion du savoir). Une découverte profite à toute la société, mais l'innovateur privé ne peut pas en capter l'intégralité des bénéfices financiers (le rendement social est supérieur au rendement privé). C'est pourquoi l'État intervient en créant des monopoles temporaires (brevets) pour garantir la rente de l'innovateur, et en distribuant des subventions publiques (ex: Crédit d'Impôt Recherche).